Phylogenetic Tree & Borrelia

borrelia är en åkomma som orsakas av bakterien Borrelia burgdorferi , en patogen sänds blacklegged fästingar. Som med många andra patogener , har biologer kunnat reda ut lite av B. burgdorferi evolutionära historia genom genetisk analys . Ett fylogenetiskt träd för en bakterie som B. burgdorferi ger en visuell illustration av dess relationer med andra stammar och arter . Fylogenetiska träd

Ett fylogenetiskt träd visar de evolutionära sambanden mellan olika arter . Varje " nod " på trädet representerar framväxten av en ny art , och om två arter kan spåra sina anor tillbaka till en enda nod , representerar denna nod den senaste tidpunkt som dessa två arter delade en gemensam förfader . Dessa träd är konstruerade utifrån fysiska och genetiska egenskaper , och evolutionsbiologer ofta tvingas ändra dem när nya uppgifter framkommer.
Borrelia

Borrelia är faktiskt en genus av bakterier som innehåller flera arter. Antalet Borrelia arter har ökat flera gånger under de senaste två decennierna som flera stammar identifierades . Definiera arter av Borrelia eller andra släkte av bakterier är faktiskt ett mycket knepigt problem . När växter och djur är berörda , har biologer traditionellt definierade arter baserat på deras oförmåga att föda upp och producera fertil avkomma . En häst och åsna kan föda , till exempel, men det mula som resulterar är steril , så hästar och åsnor är separata arter . Bakterier dock reproducera sig asexuellt , så denna definition är irrelevant . Följaktligen , för Borrelia och för många andra bakterier , mikrobiologer definiera arter som distinkt bygger på en teknik som kallas hel DNA - DNA-hybridisering . Addera ditt kommenterar: Relationer

Forskare har konstruerade fylogenetiska träd för Borrelia- arter som bygger på en teknik som kallas multilocus sekvensanalys ( MLSA ) , som tittar på skillnader mellan specifika " housekeeping " gener som finns i alla de olika arterna . Biologer använda denna programvara för att bygga den " mest snåla träd " - Det fylogenetiska trädet som kräver det minsta antalet evolutionära förändringar för att förklara de observerade skillnaderna . Resultat från denna metod , dock ofta behöva förfinas när ny information blir tillgänglig .

Relationer

närvarande B. burgdorferi egentlig bemärkelse delar sin senaste gemensamma förfader med B. bissettii ; dessa två i sin tur har en gemensam förfader med B. lusitaniae . Alla tre arterna avvikit från en gemensam förfader som de delar med B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii och B. bavariensis . Denna grupp av arter som i sin tur avvikit från en gemensam förfader som delas med B. valaisiana . Det är viktigt att notera dock att denna fylogenetiskt träd kan mycket väl ändras i framtiden eftersom nya uppgifter kommer fram . Framför allt är det mycket möjligt att den minskade kostnaden för genomsekvense kan påverka det sätt på vilket fylogenetiska träd är utvecklade för bakterier som B. burgdorferi . Addera